行業(yè)動(dòng)向

每當John Hogenesch看到自己實(shí)驗員的臉上布滿(mǎn)陰云，他就知道細胞培養又出了岔子。這時(shí)他就會(huì )建議，“檢查下支原體污染吧”。

在細胞研究領(lǐng)域，支原體是臭名昭著(zhù)的污染源，許多實(shí)驗室都深受其害。日前賓夕法尼亞大學(xué)的研究人員發(fā)現，支原體污染比我們想象的更加普遍。

支原體感染能在不知不覺(jué)中干擾研究結果，浪費大量的資金投入。為此，Hogenesch和Anthony Olarerin-George進(jìn)行了廣泛的樣本分析，他們發(fā)現目前有超過(guò)十分之一的基因表達研究（許多曾發(fā)表在*雜志上），表現出支原體污染的跡象。

Hogenesch實(shí)驗室去年就遇到過(guò)一次支原體污染，雖然問(wèn)題很快得到解決，但仍然浪費了大約100,000美元和一年的研究。支原體一般來(lái)自于實(shí)驗室工作人員，它們很快就能生根，一次小小的疏忽就可能使整個(gè)實(shí)驗室的細胞受到污染。其他許多微生物污染會(huì )使培養基變得渾濁，可支原體污染*是*跡的，而且細胞培養中常用的抗生素都殺不死支原體。

支原體一直是個(gè)令人頭疼的問(wèn)題。早期的HeLa細胞培養深受其害，HeLa細胞系建立于二十世紀五十年代，被廣泛用于各種領(lǐng)域的研究。1993年的研究顯示，美國FDA實(shí)驗室的兩萬(wàn)個(gè)培養物中有15%受到了支原體的污染?，F在，供應細胞和試劑的公司都會(huì )進(jìn)行非常嚴格的支原體篩查。

為了全面了解支原體污染情況，Hogenesch和Olarerin-George獲得了九千多份樣本的RNA測序數據，這些樣本來(lái)自于2012年-2013年間哺乳動(dòng)物細胞的基因表達研究。他們在測序數據中尋找支原體DNA，結果發(fā)現11%的樣本都受到了支原體的污染。

Hogenesch指出，支原體DNA水平zui高的一些研究，曾發(fā)表在Cell、Nature和PNAS等*雜志上。雖然支原體污染并不一定意味著(zhù)這些研究結果無(wú)效，但這種微生物會(huì )影響數百個(gè)基因的表達，并與細胞競爭營(yíng)養阻礙細胞的生長(cháng)。在其中一組受污染的數據中（淋巴瘤細胞），Hogenesch和Olarerin-George鑒定了61個(gè)被支原體改變的基因。相關(guān)數據目前可以在bioRχiv上看到，Hogenesch等人很快就會(huì )將自己的發(fā)現提交給同行評議的雜志。

污染是“草率操作”的結果，德國菌種保藏中心的Hans Drexler說(shuō)，“支原體并非憑空出現，是被人帶到細胞培養物中的。” Drexler對這項研究的結果并不驚訝，他在2010-2013年間收到的人白血病細胞和淋巴瘤細胞中，受到支原體污染的比例也差不多是十分之一。不過(guò)這已經(jīng)算是有進(jìn)步了，因為二十世紀九十年代的支原體污染率是四分之一。

Drexler認為，支原體污染持續存在的根源在于，研究界的細胞系“黑市交易”，研究者們常常很隨意的共享細胞培養物。他估計這類(lèi)細胞系中差不多有10%受到污染，而來(lái)自正規供應商的細胞系則不存在支原體污染。為此，他呼吁研究者們多花點(diǎn)錢(qián)從信譽(yù)良好的地方獲取細胞系，并且對已有的細胞系進(jìn)行支原體檢測。

“我們必須一直保持警惕，及時(shí)清除受到支原體感染的細胞，將其中的微生物一同摧毀。” Hogenesch說(shuō)。

from bio360

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